Panaskan oven hingga 375°F (190°C).

Oleskan pasta tomat di bagian dasar loyang panggang berukuran 10 inci persegi. Taburkan dengan bawang bombay dan bawang putih. Aduk air dan 1 sendok makan minyak zaitun hingga tercampur rata. Bumbui dengan garam dan merica.

Atur irisan bergantian dari terong, zucchini, labu kuning, paprika merah, dan paprika kuning, mulai dari tepi luar loyang dan bekerja secara konsentris menuju tengah. Tumpuk irisan sedikit untuk menampilkan warna-warna.

Siram sayuran dengan sisa 3 sendok makan minyak zaitun; bumbui dengan garam dan merica. Taburi dengan daun thyme. Tutupi sayuran dengan selembar kertas perkamen yang dipotong sesuai ukuran.

Panggang dalam oven yang sudah dipanaskan sampai sayuran matang dan empuk, sekitar 45 menit.