Panaskan oven hingga 375°F (190°C). Lapisi loyang dengan kertas roti atau aluminium foil.

Belah labu spaghetti menjadi dua bagian memanjang, keruk bijinya, dan letakkan sisi potongan menghadap ke bawah di loyang yang sudah disiapkan.

Panggang labu dalam oven hingga empuk saat ditusuk dengan pisau, sekitar 30 menit.

Angkat labu dari oven dan, setelah cukup dingin untuk disentuh, suwirkan dagingnya menjadi serat-serat menggunakan garpu.

Panggang biji labu (pepitas) dalam wajan besar tanpa minyak di atas api sedang, sampai harum, sekitar 2 menit. Angkat dan sisihkan.

Panaskan minyak zaitun di wajan yang sama di atas api sedang. Tambahkan bawang putih, jamur, dan bumbu adobo. Masak hingga jamur mulai layu, sekitar 4 menit.

Tambahkan paprika merah cincang ke dalam wajan dan masak hingga lunak, sekitar 4 menit.

Aduk bayam dan masak hingga layu, sekitar 2 menit.

Tambahkan labu spaghetti yang telah disuwir ke dalam wajan dan aduk rata. Tumis hingga panas sepenuhnya, sekitar 4 menit.

Angkat wajan dari api. Tambahkan keju cotija dan biji labu panggang, aduk rata. Bumbui dengan garam dan merica.